Membres
La partie biologique de spectrométrie de masse John L. Holmes de l'Université d'Ottawa soutient la recherche de haute qualité et d’améliore l'expérience éducative des étudiants.

Membres

Dr. Zoran MINIC
Manager de la plateforme du spectromètre de masse biologique
Zoran Minic a obtenu sa maîtrise en biologie intégrative des systèmes et en pharmacologie en 1995 et son doctorat en biologie et écologie végétales (1998) en France à l'Université de Paris XI. En 2004, il a obtenu l'habilitation à diriger des recherches (HDR) à l'Université de Paris VII. Au cours de sa carrière de chercheur, il a travaillé sur divers projets liés à la biochimie, à la chimie analytique et à la biologie des systèmes (protéomique, transcriptomique et métabolomique) en utilisant des organismes modèles tels que les humains, les animaux, les plantes, les champignons et les micro-organismes.
Après avoir obtenu son diplôme, il a été employé à l'INRA (Institut National de la Recherche Agronomique). Il a participé à des projets industriels visant à développer des bactéries fermentant le lactose. Au même institut, il a travaillé pendant quatre ans sur des projets relatifs à la remodulation des polysaccharides végétaux afin d'obtenir un produit digestible satisfaisant, important pour l'alimentation animale et les bioproduits. Les projets décrits précédemment reposaient sur des collaborations avec des partenaires industriels.
Après s'être installé au Canada, il va d'abord travailler comme associé de recherche professionnel à l'Université de Saskatchewan. Son projet portait sur le développement d'une nouvelle génération d'agents antifongiques et antimicrobiens pour la protection des cultures. À l'université de Regina, il a travaillé en tant que manager responsable de l'exploitation et de la maintenance des plateformes protéomiques à haut débit. Ses principales responsabilités comprenaient la préparation et le traitement d'échantillons et le développement de méthodes pour des projets protéomiques à grande échelle à l'aide du spectromètre de masse Orbitrap Elite de pointe couplé à EASY nLC 1000. Depuis 2017, il travaille en tant que manager de la plateforme du spectromètre de masse biologique à John L. Holmes de l'Université d'Ottawa. Ses principales responsabilités comprennent la préparation et le traitement d'échantillons biologiques et le développement de méthodes d'analyse protéomique et métabolomique à grande échelle à l'aide de spectromètres de masse de pointe : Orbitrap Fusion, Q-Exactive et Waters SYNAPT G2HDMS. Ses fonctions comprennent également la consultation scientifique, la conception de protocoles de préparation des échantillons et l'aide au développement et à la mise en œuvre de méthodes expérimentales basées sur la spectrométrie de masse. Il a dirigé et supervisé des cours de formation technique et des ateliers sur la spectrométrie de masse pour des chercheurs, des étudiants diplômés et non diplômés. Au cours des quatre dernières années, il a organisé des ateliers et enseigné le cours de troisième cycle CHM 8352.
Au cours de sa carrière de chercheur et de gestionnaire, Zoran a acquis une solide expérience en protéomique, métabolomique, chromatographie liquide, spectrométrie de masse et techniques de purification, de caractérisation, de quantification et d'identification des biomolécules. Son travail dans les plateformes scientifiques de l'Université de Saskatchewan, de Regina et d'Ottawa comprenait l'entretien, l'étalonnage et le dépannage d'instruments analytiques sophistiqués tels que différents types de chromatographie liquide (« HPLC, UPLC ou nLC et FPLC ») et des spectromètres de masse à haute résolution (HRSM).
Il a contribué à l'obtention de financement scientifiques et participe activement sur ses partenariats de recherche en collaborant avec des industries et le monde universitaire. Sa plateforme du spectromètre de masse fournit des services à différents utilisateurs au Canada, aux États-Unis, en Allemagne, en Espagne, en Italie, au Japon, au Mexique, au Brésil, en Chine, en Serbie et en Russie. Il est l'auteur/co-auteur de plus de 90 articles de journaux académiques, chapitres de livres et brevets.

Abdullah Khraibah
Analyste de données, spectromètre de masse
Abdullah Khraibah a obtenu son diplôme de premier cycle en biochimie et sa maîtrise en chimie à l'Université d'Ottawa. Au cours de son programme de maîtrise, Abdullah a mené ses recherches sous la supervision du Dr Maxim Bereozovski. Son projet de maîtrise portait sur la protéomique comparative entre les exosomes dérivés des lignées cellulaires MCF-10A et MDA-MB-231, dans le but d'identifier des biomarqueurs potentiels. En outre, Abdullah a participé à une recherche collaborative portant sur la métabolomique comparative entre les exosomes dérivés des lignées cellulaires MDA-MB-231 et MCF-10A. Grâce à ces divers projets, Abdullah a acquis des connaissances approfondies sur les flux de travail en protéomique et en métabolomique.
Au sein de l'installation de spectrométrie de masse John L. Holmes, Abdullah assume de multiples responsabilités, en particulier dans le domaine des analyses bioinformatiques, où il apporte plus de cinq ans d'expérience dans l'analyse des données. En tant que spectrométriste de masse, Abdullah fait preuve d'une bonne maîtrise de divers instruments, notamment le GC-MS (Agilent), l'UPLC-MS/MS (Waters) et le MALDI (Bruker). En tant que principal analyste de données de l'installation, Abdullah joue un rôle crucial dans l'organisation d'ateliers sur la protéomique et la métabolomique, contribuant ainsi au transfert de connaissances et au développement de compétences dans ces domaines spécialisés.
En plus de soutenir les étudiants de l'Université d'Ottawa dans leur progression académique, Abdullah vise à établir un cadre d'analyse métabolomique robuste et complet pour les plantes en utilisant une combinaison de technologies GC-MS et LC-MS. Ses objectifs professionnels comprennent également le développement et l'optimisation des méthodes de traitement des échantillons et des pipelines analytiques. En outre, Abdullah fournit des services de conseil sur la conception et l'analyse de projets à des clients de divers secteurs, y compris les universités, les institutions publiques et l'industrie privée. Pour en savoir plus sur les contributions et l'expertise d'Abdullah en matière de recherche, veuillez consulter ses .

Yingxi (Cici) Li
Technicien
Yingxi (Cici) Li fait partie de l'installation de spectrométrie de masse John L. Holmes en tant que technicienne depuis 2023. Elle a obtenu une licence en biochimie à la Northeastern University, Boston, MA, et une maîtrise en chimie à l'Université d'Ottawa. Elle a mené des recherches sous la supervision du Dr Maxim Berezovski pendant ses études de maîtrise, en se concentrant sur l'analyse protéomique de tissus de foie de grenouille de bois dans différentes conditions à l'aide de la spectrométrie de masse, ainsi que sur l'étude des biomarqueurs du cancer du sein dans les vésicules extracellulaires.
Après avoir terminé ses études de premier cycle, elle a rejoint Tarveda Therapeutics, où elle a contribué à des projets industriels liés à un médicament en phase 2 d'essais cliniques. Elle était responsable du contrôle de la qualité et des tests de stabilité à court et à long terme des nouvelles formulations de médicaments dans un environnement GMP. Après avoir déménagé au Canada, elle a travaillé sur de nombreux projets appliquant des techniques analytiques basées sur la spectrométrie de masse pour répondre à diverses questions biologiques dans le domaine de la découverte de biomarqueurs, de la biologie du cancer, des sciences alimentaires, de la microbiologie et de la toxicologie du mercure.
Les tâches de Cici au sein de la FMSLJ comprennent le traitement des échantillons, l'analyse bioinformatique, le développement et l'optimisation des méthodes de traitement des échantillons et des pipelines, la conception de projets de conseil et la formation en matière de protéomique et de métabolomique. Elle a de l'expérience dans le traitement de différents types d'échantillons biologiques, tels que les tissus, le plasma, le liquide céphalorachidien, les vésicules extracellulaires, la salive et les lignées cellulaires. Elle fait également partie du comité d'organisation de plusieurs ateliers de protéomique et de métabolomique organisés par le JLHMS.
par des méthodes de traitement avancées, ce qui nous a permis de traiter des échantillons biologiques complexes, d'obtenir une grande pureté des peptides et d'augmenter la détection des protéomes. La plupart des analyses de données pour la FMSJLH sont effectuées pour permettre des analyses statistiques puissantes, des analyses fonctionnelles biomoléculaires et des analyses de voies, ainsi que la visualisation des données.
Grâce à son expertise dans le traitement des échantillons et l'analyse des données, Cici joue un rôle essentiel dans l'avancement des capacités de recherche de l'installation et dans le soutien d'un large éventail de projets en protéomique et en métabolomique.
Past Members

Nico Hüttmann
Analyste de données
Adresse actuelle: EMBL, Allemagne
Ph.D. Étudiant diplômé
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Analyse biologique
Zoran Minic
[email protected]
Marion Hall - Salle 02
Ottawa, ON K1N 1A2
Tél: 613-562-5800 ext. 1626